وسنذكر فيما يلي أسماء كتب القاضي التي ذكرها ابنه أبو الحسين وغيره. ونبتدئ بذكر الموجود منها ومكان وجوده.

‌‌(1) إبطال التأويلات لأخبار الصفات:
هذا الكتاب كما هو ظاهر من عنوانه في إثبات الصفات وذم التأويل ومنعه، وحمل الآثار في الصفات على ظاهرها من غير تشبيه ولا تأويل ويقع في 190 ورقة، وعدد السطور في الصفحة 17 سطرًا تقريبًا.
وكان الكتاب يعد عند العلماء من الكتب المفقودة ولم يظهر إلا أخيرا حيث وجده الشيخ صبحي السامرائي من أهل العراق في بغداد في مكتبة نعمان الألوسي، وأرسل منه نسخة مصورة للشيخ حماد الأنصاري رحمه الله.
وقد طبع جزء منه بتحقيق أبي عبد الله محمد بن حمد الحمود النجدي طبعته مكتبة الإمام الذهبي.

‌‌(2) الأحكام السلطانية:
موضوع الكتاب: السياسة الشرعية. وقد طبع هذا الكتاب بتحقيق الشيخ محمد حامد الفقي. . طبعته مطبعة مصطفى البابي الحلبي عام (1356) وعام (1386).
وقد قام بدراسة الكتاب مع دراسة مؤلفه في رسالة دكتوراه "الدكتور محمد عبد القادر أبو فارس". واسم كتابه "القاضي أبو يعلى وكتابه الأحكام السلطانية". وطبعت هذه الرسالة في كتاب طبعتين، الطبعة الأولى عام 1400 هـ، والطبعة الثانية عام 1403 هـ، طبعته مؤسسة الرسالة في بيروت. وعدد صفحاته من غير الفهارس 547 صفحة.